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BLAST2GO 的本地安装( Ubuntu )

BLAST2GO 的本地安装( Ubuntu )

基本介绍

Blast2GO是一套集成的比较成熟的序列功能注释和分析平台, 可以整合NR, Swiss-prot 以及Interproscan的结果对序列进行功能Gene Ontology(GO)的功能分类。 Blast2GO是针对实验人员设计的,具有友好直观的界面。在处理大量序列时,虽然可以提交上千条序列在线分析,但是很费时且不能有效的控制软件版本,所以本地安装并基于命令行的运行模式显得尤其必要。

基本步骤 Mysql安装及其创建用户 Mysql 安装 sudo apt-get install mysql-server mysql-client mysql-workbench

安装过程中会提示输入root的密码: 你也可以后面使用下面的命令设置root密码:

sudo mysqladmin -u root -hlocalhost password ‘biostack’

测试

$ mysql Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ; or \g. Your MySQL connection id is 41 Server version: 5.5.31-0ubuntu0.12.04.2 (Ubuntu)

Mysql安装版本:Mysql […]