在Ubuntu上安装InterProScan（Ubuntu）

Related：BLAST2GO数据库本地化安装

基本介绍

Interproscan 组合了不同的蛋白质特征（protein signature）数据库，包括了 Pfam ， PIR，SMART，Gene3D，TigrFam，SuperFamily，TMHMM，SignalPHMM，FPrintScan以及PatternScan等。通过InterPro，我们可以利用这些数据库更好的注释和了解蛋白质功能等详细信息，此外，我们也可以容易的和GO进行关联，极大的丰富蛋白质的GO功能注释。

基本步骤 安装Perlbrew

为了安装本地的IPRscan，需要安装好多Perl的包，在Ubuntu 12.04 上Perl 版本是 5.14.2，最新的是5.18.0，很多包不都这么支持了，比如 File::Basename， English，不过 perlbrew ， 可以很方便的安装多个Perl版本，以及随意切换， 在Perl 5.18.0 环境下可以将IPRscan需要的包顺利安装完成。

设置perlbrew 安装路径：

export PERLBREW_ROOT=/home/biostack/tools/perl5

安装perlbrew

wget -O – http://install.perlbrew.pl | bash

bashrc 中添加：

#perlbrew export PERLBREW_ROOT=/home/biostack/tools/perl5 source /home/biostack/tools/perl5/etc/bashrc

初始化

perlbrew init

选择镜像

perlbrew mirror

查看可以安装的perl 版本

perlbrew available

安装perl-5.18.0

perlbrew install […]