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基因表达水平高低的影响因素分析

细胞表达一个基因,即将基因转录成RNA,,并翻译成蛋白的效率是不同的。除与基因本身有关外,表达水平的高低也与细胞中的各种分子机器启动基因表达的强度有关。如启动子就是RNA转录的必需因子,而RBS也是对该过程有重要影响的因素。在过去,很多科学家已经从微生物中鉴定出各种不同强度的启动子,RBS等调控元件,并利用这些元件调控基因的表达水平。但是在实践中,利用这些调控元件表达相关基因的活性与预测的结果相差甚远。这两篇文章向大家介绍影响原核生物基因表达水平高低的主要调控元件。在此基础上,BIOFAB的工作人员设计了BCD结构,这个元件不干扰下游在DNA的启动子和RBS序列,且与搭配的基因无关,能够更严格的控制基因的表达,使基因表达水平与预测水平之间的符合度达到93%。这项研究对精确调控基因表达有重要的作用。

Related paper: Mutalik, V. K., et al. (2013). “Quantitative estimation of activity and quality for collections of functional genetic elements.” Nature methods. Mutalik, V. K., et al. (2013). “Precise and reliable gene expression via standard transcription and translation initiation elements.” Nature methods 10(4): 354-360.